导致严重脚气的原因主要包括个人卫生意识薄弱，治愈后如仍继续忽视预防措施和调理，极易再度感染；此外不当的药物选择及使用方式往往也会引发抗药性问题，进一步加剧治疗难度，使病情加重。
1. 即便是已治愈的脚气患者，若日常生活中疏于防范，在特定场合再次接触到真菌，便可能再次患上脚气，此现象称为“再感染”。
2. 部分脚气患者在使用抗真菌药物治疗时，因未能坚持、按医嘱或药品说明正确用药，待症状缓解后擅自停药，实际上真菌并未完全清除，经过一段时间后将重新大量繁殖，导致“复发”。
3. 真菌具有顽强的生命力，在-6℃的低温下可长期存活；即使在120℃的高温环境中，10分钟内亦不会死亡；而在脱离宿主的毛发、指甲、皮屑等表面，其毒性可维持长达一年之久。目前市面上治疗脚气的药物大多只能起到抑菌作用，无法根治，因此容易出现反复发作的情况。
部分患者由于对医学知识了解不足，误用含有激素成分的药物进行治疗，虽能短暂止痒，看似病情有所改善，实则无抗真菌功效，致病菌非但未被消灭，反而更加肆虐，同时还会干扰甚至阻断局部免疫反应。若足癣未能得到及时有效的治疗，有时可蔓延至其他部位，引发手癣、甲癣等并发症，甚至因瘙痒难耐而抓挠破损，继发细菌感染，导致严重后果。
