针对脚气病，治疗关键在于辨明症状，依据病情挑选适宜治疗方案，例如：若初期表现为角质层增厚，此时仅用药见效缓慢，可采用水泡脚法软化角质以利于药液吸收，从而提高疗效；若趾间有糜烂现象，可用高锰酸钾溶液或粉剂治疗。
1. 趾间有糜烂、渗液的脚气病患此类病患不宜使用刺激性强的药物，宜先使创面收敛干燥再行用药。可用1:8000高锰酸钾溶液湿敷，随后涂抹油剂或粉剂，待皮肤干燥后换用盐酸特比萘芬等霜剂或软膏。
2. 角质层增厚严重且抗真菌药物难以渗透吸收的脚气病患可先用10%水杨酸软膏或复方苯甲酸软膏等软化角质，再用抗真菌药。对于皮肤干裂明显的病患，可在温水浸泡后局部涂油膏，并用塑料薄膜封包，外缠绷带，24~48小时后去除，再用抗真菌药治疗。
3. 足部起小水疱，未破溃者可先用3%硼酸溶液浸泡，然后选用联苯苄唑乳膏等抗真菌霜剂治疗。
4. 足癣合并细菌感染者原则上应先局部抗细菌感染，可用呋喃西林溶液或1:2000黄连素溶液湿敷，严重感染者需口服抗生素，如头孢氨苄胶囊、红霉素等。破溃处禁用酊剂，皮肤变厚、裂口时应用软膏。
